Кафедра заснована 1922 року. Першим завідувачем був ґрунтознавець Ф.І. Левченко, на кафедрі працювали відомі ґрунтознавці Годлін М.М., Зражевський А.І., Золотарьов С.О., Захарчук П.В. та інші.

За значні успіхи в науковій роботі співробітники кафедри стали Лауреатами Державної премії України в галузі науки і техніки (М.К. Шикула і О.Г. Тараріко) і отримали звання Заслуженого діяча науки і техніки України (М.К. Шикула).

З 1970-х років на кафедрі функціонує школа фундатора ґрунтозахисного землеробства, професора М.К. Шикули із дослідження  і розробки ґрунтозахисних технологій вирощування культур, які базуються на мінімізації обробітку ґрунту та біологізації землеробства.  З 2010 року кафедра ґрунтознавства та охорони ґрунтів носить ім’я  професора М.К. Шикули. Наукова школа ґрунтозахисного та біологічного землеробства зберігає та примножує традиції та надбання фундатора, засновника та вчителя багатьох поколінь вчених Миколи Кіндратовича Шикули.

Вченими кафедри на основі багаторічних фундаментальних досліджень розроблені ґрунтозахисні технології вирощування культур для основних ґрунтово-кліматичних зон України, які забезпечують:

• збереження і відновлення органічної речовини ґрунту;
• підвищення вологозабезпеченості посівів завдяки підвищенню вмісту продуктивної вологи у ґрунті;
• покращення структурно-агрегатного складу і попередження агрофізичної деградації ґрунтів;
• захист ґрунту від водної та вітрової ерозії;
• зниження собівартості продукції рослинництва завдяки ресурсо- та енергозбереженню.

   Колектив кафедри, 2022 р. 

Зліва направо: перший ряд (сидять) - професор А.Д. Балаєв, професор С.Ю. Булигін,

завідувач кафедри В.О. Забалуєв, доцент С.В. Вітвіцький, доцент М.Ф. Бережняк;

другий ряд – зав. лабораторією О.В. Субботіна, доцент В.М. Козак, професор О.Л. Тонха,

доцент Р.П. Богданович, доцент О.В. Піковська, доцент С.Ю. Кравченко,

ст. лаборант Н.В. Волошина, доцент К.С. Карабач, доцент В.Г. Носенко,

 лаборант І.В. Кучеренко, ст. лаборант Н.П. Рябчун

          Нині на кафедрі працює 14 науково-педагогічних працівників, з них 4 докторів сільськогосподарських наук і 10 кандидатів наук. Професор А.Д. Балаєв є головою Українського товариства ґрунтознавців та агрохіміків (УТГА). Члени кафедри беруть активну участь у з’їздах УТГА. У науковій роботі беруть участь викладачі кафедри, аспіранти, магістри і студенти.
        За останні роки викладачами кафедри підготовлено і видано велику кількість навчально-методичної і наукової літератури, а саме: 3 підручники, 10 посібників, більше сотні статей у наукових виданнях. Підручники «Охорона ґрунтів» і «Ґрунтознавство з основами геології» дістали схвальну оцінку як викладачів, так і студентів, і стали базовими для викладання ґрунтознавчих дисциплін.
         За увесь період роботи кафедрою підготовано 20 докторів, близько 100 кандидатів наук, видано 75 підручників, навчальних посібників і монографій, отримано 27 авторських свідоцтв на винаходи та патентів. Члени кафедри були відзначені високими науковими званнями академіка НААН (О. Г. Тараріко, С. Ю. Булигін, В. А. Величко), член-кореспондента НААН (А. Д. Балаєв), Заслуженого діяча науки і техніки України (М. К. Шикула), Лауреата Державної премії України (О. Г. Тараріко, М. К. Шикула). Співробітники кафедри брали участь у підготовці прийнятих або підготовлених до прийняття Верховною Радою Законів України «Про охорону земель», «Про загальнодержавну програму використання і охорони земель», «Про органічне виробництво».
       Розвивається співробітництво з провідними навчальними і науковими установами як вітчизняними, так і інших країн. Співробітники кафедри стажувались або брали участь в наукових конференціях у Китаї, Англії, Франції, Швейцарії, Швеції, Нідерландах, Німеччині. За останні роки кафедра також приймала для стажування, обміну досвідом і розширення наукових знань викладачів з університетів Китаю, Сирії, Туреччини.

На даний час кафедра ґрунтознавства та охорони ґрунтів ім. проф. М.К. Шикули є однією з провідних кафедр Національного університету біоресурсів і природокористування України. Вона є випускною кафедрою агробіологічного факультету, здійснює підготовку бакалаврів і магістрів за спеціальністю «Агрохімія і ґрунтознавство» та викладає ґрунтознавчі дисципліни на дев’яти факультетах університету. Кафедра має аспірантуру та докторантуру з наукової спеціальності «Агроґрунтознавство і агрофізика» і щорічно випускає спеціалістів вищої кваліфікації.

До 125-ї річниці створення університету колектив кафедри ґрунтознавства та охорони ґрунтів підійшов з почуттям великої відповідальності за збереження і продовження славних традицій попередніх поколінь викладачів і науковців, бажанням працювати над вирішенням гострих проблем наукового забезпечення земельної реформи, а також з усвідомленням своєї ролі в підготовці кваліфікованого фахівця нового покоління, здатного забезпечити надійний захист, ефективне використання і відтворення найбільшого багатства України – родючих ґрунтів.